O MAE oferece diversas disciplinas optativas de Graduação. Alunos/as da USP e outras Universidades têm a oportunidade de adquirir uma consistente visão das bases conceituais e práticas da Arqueologia e de sua interface com outras áreas do conhecimento.
O acesso dos/as alunos/as ao universo dos problemas arqueológicos visa enriquecer sua formação acadêmica e contribuir para despertar potenciais vocações para o exercício da disciplina.
As disciplinas de Graduação oferecidas pelo MAE a cada semestre podem ser cursadas como optativa livre por alunos/as de qualquer unidade da USP e por pessoas de fora da USP que tenham concluído o Ensino Médio (na categoria de aluno/a especial).